Una dintre problemele cu combustibilul în sine este creșterea NOx a emisiilor de biodiesel. De multe ori, în diesel producere comustibil, atunci când reduce cantitatea de pulberi în suspensie în emisiile, există o creștere corespunzătoare a oxizilor de azot, care contribuie la formarea smogului formarea. Deși o parte din acest lucru poate fi abordată prin ajustarea motorul în sine, care nu este întotdeauna posibil. Există tehnologii în curs de cercetare, pentru a reduce NOx se ridică în emisiilor de biodiesel.
O altă problemă este comportamentul biodiesel ca un solvent. Deși această proprietate este de ajutor, este un fel de sabie cu două tăișuri. Unele vehicule diesel mai vechi (cum ar fi mașinile fabricate înainte de 1992) se pot confrunta cu colmatarea concentrații mai mari de biodiesel. Datorită capacității sale de a slăbi depozitele constituite în motorul (care poate fi acolo de la motorina vechi), biodiesel poate provoca filtrul de combustibil pentru a deveni blocat cu depozitele nou eliberate. Producatori de biodiesel sugerează schimbarea pompei de combustibil la scurt timp după trecerea la mare concentrație amestecuri de biomotorină. Componente cadrul acestor sisteme de combustibil mai vechi pot deveni, de asemenea, degradate. În plus față de depozitelor în sistemul de combustibil, biodiesel, de asemenea, descompune componente de cauciuc. Unele părți în sistemele mai vechi, cum ar fi liniile de combustibil și sigilii pompă de combustibil, poate deveni defalcate din cauza cauciuc sau compoziție cauciuc cum ar fi. Acest lucru este, de obicei, remediată prin înlocuirea acestor componente. Deși mulți producători au inclus biodiesel în garanții lor, potențialul de probleme ar putea exista încă. Pentru mai multe informații cu privire la biodiesel și vehicule garantii, a verifica afară de Biodiesel Standard.
De asemenea, în unele motoare, nu poate fi ușoară scădere în economia de combustibil și putere. În medie, există o reducere de 10 la suta la putere. Cu alte cuvinte, este nevoie de aproximativ 1,1 litri de biodiesel la egal un galon de motorină standard de.
Principalele dezavantaje la biodiesel sunt conectate la imaginea de ansamblu, și anume piața și logistica asociată. Dintre acestea, cel mai important este costul. Potrivit EPA, biomotorina pură (B100) poate costa oriunde de la 1.95 $ la 3.00 $ pe galon, în timp ce B20
