După congres, situația politică sa schimbat din nou în Sicilia Garibaldi a câștigat Când lupta sa de a unifica Italia . În 1860, Cannizzaro făcut drum spre Palermo, unde a devenit un membru al consiliului în noul guvern. În anul următor, sa întors la Universitatea din Palermo. Ca un profesor de chimie organică și anorganică, Cannizzaro eforturile sale puse în construirea un centru de cercetare de top-notch, și Palermo a devenit un centru de conducere pentru studii chimice. Un deceniu mai târziu, sa mutat la Roma Cannizzaro, servind ca un senator și apoi ca vicepreședinte al Senatului italian. Prin toate turbulențele în viața lui, a continuat preocupări sale științifice și studiul de substanțe naturale.
în timpul ultimii săi ani, a primit Cannizzaro distinctii si premii de la multe dintre cele mai importante societati stiintifice din Italia și restul Europei, inclusiv Medalia Copley al Societatii Regale în 1891.
