Sistemul folosit pentru a clasifica lucrurile vii arata foarte mult ca un copac, cu primele organisme care alcătuiesc structura rădăcină, și diverse taxa reducerea în portbagaj, ramuri mari, ramurile mai mici și în cele din urmă în frunzele care reprezintă aproape 2 milioane de specii clasificate în prezent de știință [sursa: O'Loughlin]. Această reprezentare este adesea numit pomul vieții. Cu toate acestea, după cum filogenia a intrat din ce în ce în folosință, se arată că, probabil, rădăcinile pomului vieții sunt oarecum atipice.
Probleme cu Pomul Vieții
Compararea genetică a organismelor prevăzute de filogenia a relevat un obstacol serios în urmărirea pomul vieții înapoi la stramos comun unic care biologii anterioare nu a putut vedea. Vanatoarea de stramosul comun - și însăși ideea că o existat - se bazează pe distribuția genetice prin transferul de gene vertical. Prin aceasta, gene sunt trecea de la o generație la alta prin reproducerea sexuală sau asexuată. Fie unul sau două organisme da naștere la un alt că moștenește o replică a însuși sau o combinație previzibil din genele lor. De-a lungul timpului, organismele se pot abate in cele din urma in intregime diferite specii sau chiar împărății, ca si oamenii de la maimuțele (sau, chiar mai departe înapoi, în cazul în care linia care a dat naștere la pasari deviat de la care bacteriilor), dar acest transfer orizontal de gene lasă încă o traseu de pesmet genetice putem urma pentru a urmări originile noastre.
faptul ca genele au fost transferate numai pe verticală a fost punctul de vedere predominant de oameni de stiinta până în anii 1950, atunci când a fost descoperit un alt tip de transfer de gene. Transferul de gene orizontal sau lateral este un alt mijloc de un organism obținere genele altuia, ci mai degrabă decât mama la urmasi, această metodă de distribuire genetice se bazează pe un organism absorbind în mod eficient un alt organism de ansamblu ADN și intact [sursa: Wade]. Două organisme pot crea un al treilea organism hibrid, aparent fără legătură cu ambele gene, dar nu în nici un fel similar cu egal combinarea de gene care apare în timpul reproducerii. În schimb, o mai mare organism poate manca practic un alt organism și să păstreze codul genetic al doilea organismului, folosind codul primul organism pentru sine. Mitocondriile, partea a celulei responsabile pentru convertirea zahar
