În 1975, Cooper a ajutat găsit Nestor, Inc., pentru a dezvolta software-ul de calculator și sisteme hardware numite retele neuronale, care încearcă să imite rețelele de celule nervoase din creier și procesele sale de comportament. Oamenii de știință care lucrează cu această formă de inteligență artificială sunt implicate în proiectarea sistemelor informatice care se aplică concepte de modelare neuronale la probleme tehnologice. Un astfel de sistem informatic nu este programat în același mod ca un calculator convențional, dar în schimb este proiectat să învețe prin exemplul de a recunoaște modele complexe. Nestor a devenit un lider in industria de aplicarea sistemelor neuralnetwork la aplicații comerciale și militare. Până în 2001, Nestor a devenit implicate în sistemele de monitorizare bazate pe video și servicii pentru siguranța traficului.
Cu un coleg, Cooper a dezvoltat un sistem software care ar putea recunoaște și transforma litere scrise de mână în caractere tastate. Internațională Business Machines Corporation (IBM) a introdus sistemul în 1987.
În 1991, Cooper a devenit primul director al Institutului Universitatea Brown pentru Brain si neuronale Systems. Institutul reunește matematicieni, psihologi, ingineri, fizicieni, lingvisti, oameni de stiinta de calculator, biologi și pentru a studia modul de funcționare a creierului și sistemului nervos al animalelor superioare, inclusiv ființe umane.
Cooper a fost distins cu sapte de onoare grade. El este un membru al Academiei Americane de Arte si Stiinte, American Physical Society, Academia Nationala de Stiinte, American Philosophical Society, și un sponsor al Federației Oamenilor de Știință Americani. În 1968, împreună cu Schrieffer, el a fost distins cu Premiul Comstock al Academiei Nationale de Stiinte.