Această metodă directă de determinare structura moleculara, cu toate acestea, nu a găsit imediat acceptare largă. Complexitatea matematica necesare pentru a rezolva aceste structuri a fost de intimidare la multe chimisti si utilizări practice metoda nu au fost la prima evidente. Metoda lor a condus la abilitatea de a identifica structurile de mii de molecule biologice, inclusiv cele ale diferitelor hormoni, antibiotice, vitamine. Karle și Hauptman de muncă de pionierat primit recunoașterea prin lor Premiul 1,985 Nobel pentru chimie.
Karle a continuat investigațiile sale în structura moleculară prin anii 1970 și, printre multe alte realizări, în 1980 a publicat mai multe lungimi de undă tehnica sa de dispersie anormală, care a deschis ușa pentru a continua progresele în domeniul analizei structurii macromoleculare. El a fost un lector invitat la locații în întreaga lume, a castigat zeci de premii, și a primit multe diplome de onoare de la universitati de prestigiu din întreaga țară.
De ce a câștigat Premiul Nobel, Karle-a dedicat, de asemenea, mult timp și energie spre lucru cu elevii și cu organizațiile al căror scop este îmbunătățirea calității vieții pentru toți oamenii.