Baltimore a luat o serie de cauze științifice. În anii 1970, atunci când oamenii de știință și publicul exprimat ingrijorarea cu privire potențialele pericole implicate cu procedurile gena-despicare, el a contribuit la dezvoltarea orientări pentru a asigura siguranța în laborator. Câțiva ani mai târziu, el a făcut lobby la fel de greu pentru a avea aceste regulamente diminuat ca oameni de stiinta au crescut mai mult la ușurința cu tehnici de cercetare genetica. De asemenea, el a contribuit la stabilirea orientărilor federale privind Proiectul genomului uman. De asemenea, el a fost un avocat pentru cercetare SIDA și cursa pentru a găsi un vaccin SIDA.
În timp ce lucra la Institutul Salk, Baltimore întâlnit viitoarea soție, Alice Shih-hou Huang, un microbiolog. Cele Baltimores căsătorit în 1968 și au o fiică.
