Academia suedeză Royal atribuit Yukawa Premiul Nobel pentru fizică în 1949 "pentru predicția lui de existenta mezonilor pe baza muncii teoretice asupra forțelor nucleare." Powell a primit Premiul Nobel din 1950 in fizica, în parte pentru descoperirile sale privind mezoni.
De la 1948-1949, Yukawa a fost profesor invitat la Institutul pentru Studii Avansate din Princeton, New Jersey. Apoi a predat la Universitatea Columbia din New York City. El a servit ca director al Institutului de Cercetare pentru Fizica fundamentale, acum Institutul Yukawa pentru Fizica fundamentale, de la Universitatea Kyoto din 1953 la 1970.
În 1955, a devenit Yukawa 1 din 11 oameni de stiinta eminenti, care a pus numele pe o document care a ajuns să fie numit manifestul Russell-Einstein. Acesta a fost scris de om de știință american Albert Einstein și filosoful britanic și matematician Bertrand Russell. Manifestul Russell-Einstein chemat oamenii de stiinta din lume, indiferent de convingerea politică, să se întâlnească și discuta despre amenințarea la civilizație reprezentat de arme nucleare. Statele Unite au scazut primele bombe atomice la Hiroshima și Nagasaki în 1945 și, în 1952, a testat prima bomba cu hidrogen la Bikini Atoll din Oceanul Pacific. Prin 1955, temerile au fost în creștere cu privire la puterea distructivă a acestor arme și efectele pe termen lung ale radiațiilor nucleare.
Celelalte semnatarii erau fizicieni Max Born Germania, Percy Williams Bridgman și Leopold Infeld din Statele Unite, Frédéric Joliot-Curie a Franței, Cecil Powell și Joseph Rotblat al Regatului Unit, și chimiști Paul Hermann Muller a Elveției și Linus Pauling Carl al Statelor Unite. Yukawa a devenit, de asemenea, activ la conferințe internaționale la care oamenii de stiinta au discutat dezarmarea.
Yukawa a fost membru al Academiei Japonia și Japonia Physical Society. El a câștigat Premiul Imperial al Academiei Japonia în 1940, Ordinul Meritul Cultural în 1943, și Ordinul guvernul japonez a Soarelui Rasare in 1977. Universitatea din Kyoto a stabilit Institutul de Cercetare pentru Fizica fundamentale, acum Institutul Yukawa pentru Fizica fundamentale, pentru a comemora primirea Yukawa de Premiul Nobel.
El a fost, de asemenea, un membru străin al Academiei Americane Nationale de Stiinte, American Physical Society, Royal Society din Londra, și Academ
