Berg următor a îndreptat atenția spre studiul de gene. Genele determina caracteristicile care sunt transmise de la o generație la alta. Genele constau în principal din ADN. Berg a vrut să examineze structura si functia de gene de mamifere. La sfârșitul anilor 1960, el a inceput sa studieze genele unui virus maimuță, cunoscut sub numele de SV40. Berg început să realizeze că combinarea ADN-ul de la diferite specii ar putea fi un instrument de cercetare puternic. Această metodă îi va permite să izoleze o genă și de a studia proprietățile sale fără intervenția din genele sale obișnuite, vecine.
De ADN-ul recombinant, Berg combinat ADN-ul de SV40 cu un tip de virus de E. coli, care a fost bine înțeles. Aceste două organisme nu ar interactiona in natura, și să le facă să interacționeze în laborator, Berg folosit enzime de restricție. Aceste enzime permis Berg a reduce ADN-ului la anumite locații și apoi recombina porțiunile de ADN. Aceasta noua tehnica a fost seminal, dar nu fără riscuri. Berg îngrijorat că virusuri sau bacterii periculoase ar putea fi introdus în populația umană. Sa oprit în mod voluntar experimentele sale recombinant ADN și a lucrat pe dezvoltarea de alte tehnici pentru studierea SV40.
În 1974, Berg a scris o scrisoare, care a fost publicat in Science, exprimându-și îngrijorarea sa și cea a altor oameni de stiinta cu privire la cercetarea genetică. La acea vreme, a fost Berg președintele Comisiei pentru recombinant ADN Moleculele Adunării Life Sciences al Academiei Nationale de Stiinte. Scrisoarea a cerut o reuniune internațională de oameni d
