Procesul, care a făcut posibilă pentru a lua un eșantion minut de material genetic și duplicat suficient de ea pentru studiu, în curând găsit multe utilizări. Pentru că a permis identificarea și amplificarea rapidă a parti ale genomului uman, a jucat un rol major în efortul de a harta genomului uman. Pentru că poate genera cantități care pot fi analizate, a făcut mai ușor pentru a detecta organismele boli infectioase care au fost greu de cultură. Deoarece se poate distinge cu ușurință între variatii mici in ADN-ul, ea a condus la noi tipuri de teste genetice. Ea a devenit, de asemenea, un instrument important în investigațiile poliției, deoarece poate identifica persoana care a lăsat o picătură de sânge sau de un fir de păr la locul crimei. Utilitatea în analiza ADN-ului preistorice a sugerat parcela pentru cartea lui Michael Crichton și mai târziu film al lui Steven Spielberg Jurassic Park, în care oamenii de știință duplicat dinozaur ADN extras din un țânțar păstrat în chihlimbar. Aceasta poate ajuta, de asemenea oamenii de știință bucată împreună mii de particule de pergament din Manuscrisele de la Marea Moartă.
În 1986, Mullis stânga Cetus. Compania ia plătit doar un bonus de 10.000 $ pentru invenția sa. Mai târziu, DuPont, compania multinațională farmaceutică, a dat în judecată Cetus pe un litigiu de brevet, susținând că un chimist DuPont a inventat de fapt PCR în anii 1970. Cetus trebuit să susțină revendicările Mullis a invenției sau riscul de a pierde brevetului, care sa dovedit extrem de profitabile. Când gigantul farmaceutic Hoffmann-La Roche cumpărat brevetul de Cetus în 1991, a plătit 300 de milioane de Cetus un $ record mondial.
După ce a lucrat 1986-1988 la Xytronyx, Inc., Mullis devenit un consultant liber profesionist . Mai puțin de un an de la a deveni un laureat al Premiului Nobel, a fost interzis de la Mullis vorbind la reuniunile Societatii Europene pentru Clinical Investigation, unul dintre cele
