În plus față de învățătura sa, Bessey publicat mai mult de 150 de lucrari si comentarii. El a scris pe larg despre subiecte secete și bolilor plantelor și ciuperci. El a avut un interes în ierburi native primitive și plante. Două dintre lucrările sale, "Evoluția și clasificarea" (1893) și "filogenetică Taxonomie de plante cu flori" (1915), au fost lucrări seminale. La cererea unui editor și îndemnul de Gray, Bessey scris manualul Botanică pentru licee și colegii (1880), care a introdus noi domenii de studiu. A doua sa carte, Essentials de Botanică (1,884), a fost mai puțin tehnic și a devenit textul cel mai folosit botanica din Statele Unite ale Americii. Bessey fost, de asemenea, editorul botanic pentru două reviste de conducere, American Naturalist (1880-1897) și Știință (1897-1915).
În luna iunie 1884 Bessey stânga Iowa să accepte un post de profesor de botanică și decan al Colegiul Industrial (care a inclus școala de agricultură) de la Universitatea din Nebraska. Când Bessey ajuns, nu a existat nici un program în botanică, dar el a construit un program de solid care a inclus laboratoare cu microscoape și excursii. În timp ce la Nebraska, a construit un ierbar și o literatură bibliotecă de locuințe botanica. Bessey a servit ca decan al Colegiului de la industrial 1884-1888 și de la 1,895 la 1909 la 1888 la 1891, el a deținut funcția de dubla calitate cancelar si decan al Colegiului de Literatură, Știință și AREMD. În 1899 și 1907, el a servit ca din nou în calitate de cancelar. 
[1] [2]