În luna aprilie, 1637, indienii Pequot au atacat Wethersfield. O forță de coloniști, ajutat de Mohegan și Niantic indieni, sa răzbunat, asalt cu succes cetatea Pequot la Mystic. Forța a fost sub comanda generală a căpitanului John Mason; de Mohegans au fost conduse de Uncas, care a certat cu tatăl său-in-law, Sassacus, șef al Pequots. Războiul sa încheiat pe Pequot 13 iul 1637, când au fost învinși Pequots rămase în Bătălia de la Marea Mlaștină.
În 1639, râul orașele adoptat Ordinele fundamentale Connecticut, adesea numit prima constitutie scrisa din lume . Acesta a fost în mare măsură lucrarea lui Hooker, John Haynes, și Roger Ludlow, și a stabilit colonia de auto-guvernare din Connecticut, secționarea legăturile politice cu Massachusetts Bay Colony. Haynes a fost ales guvernator.
Între timp, alte comunități au fost fondat de colonistii englezi de-a lungul Long Island Sound. În 1638, New Haven a fost stabilită de către reverendul John Davenport și Teofil Eaton. În 1643, New Haven și așezările din apropiere organizat New Haven Colony. A căutat să rămână independentă, dar în cele din urmă a fost absorbit in colonia Connecticut în conformitate cu dispozițiile Cartei 1,662, emise guvernatorul John Winthrop, Jr., de Charles al II-lea al Angliei. Această cartă a rămas în vigoare pentru unii 150 de ani, cu excepția în timpul 1687-1689, atunci când Anglia a căutat să se unească toate coloniile sale New England ca Dominion din New England. În această perioadă, carta Connecticut a fost reputația ascuns de autorități în Engleză un stejar.
La începutul secolului al 18-lea, au existat aproximativ 30.000 de coloniști din Connecticut. În 1701, New Haven și Hartford devenit capitale comune. Agricultura a fost de temelie a economiei coloniei. Construcțiilor navale a fost important pe Long Island Sound. Industrializarea a început cu introducerea de gristmills. În 1732, prima mina de fier a fost deschis în Salisbury; în 1740 prima tinichigerie fabricate în coloniile a fost produs în Berlin. Populația din Connecticut a crescut rapid, ajungând la aproape 200.000 în ajunul Revoluției Americane.
Revoluția și Suveranității
Jonathan Trumbull, guvernator la izbucnirea Războiului Revoluționar, a fost singurul guvernator colonial simpatic la cauza american. În timpul războiul