în 1568 Mary evadat din închisoare și a ridicat o armată, care a fost învins în primul angajament, la Langside. Ea apoi a fugit în Anglia.
Exil în Anglia
Regina Elisabeta, deși prietenos pentru nobililor scoțieni, nu a fost de acord de la răsturnarea unui monarh legal și permis verișoara ei să rămână în Anglia. Cu toate acestea, Elizabeth a avut-o ținut în detenție virtuală. Maria a devenit curând centrul unei serii de parcele catolice a răsturna Elizabeth și locul Maria pe tron. În unele ea a jucat un rol direct; în altele ea nu a făcut, fiind doar se concentreze pentru complotiștii.
Primul Terenul, în 1569, a produs o revoltă de nobili catolici din nordul Angliei. Ei au fost învinși repede, iar unele 800 de rebeli au fost spânzurați. Parlamentul a solicitat executarea Mariei, dar Elizabeth a refuzat. În 1571 Roberto Ridolfi, un bancher italian în Londra și un spion papală secretă, a conceput un complot de asasinare a lui Elizabeth, au o forță spaniol invada Anglia, și locul Maria pe tron. Terenul a fost descoperit, și ducele de Norfolk, un conspirator cheie, a fost decapitat. Parlamentul a solicitat Elizabeth să ia măsuri împotriva Maria, dar ea a refuzat.
Maria a fost un participant la complotul Throckmorton (1583), care a solicitat o invazie de Franța și Spania, în numele ei. Implicarea ei în 1586 într-un sistem (The Babington Conspirația) pentru a ucide Elizabeth s-au dovedit desfacerea ei. Maria a fost încercat și găsit vinovat de trădare, și Parlamentul cerut din nou Elizabeth pentru executarea ei. După unele ezitări regina a semnat condamnarea la moarte, și Maria a fost decapitat la Castelul Fotheringhay pe 8 februarie, 1587.