Cruciații au cucerit o mare parte din Palestina, care Fatimidii susținut, facandu-i sa se alature cu sultanul turc a Siriei împotriva creștinilor. Sultanul a folosit Alianța pentru a face unul de-al său ofițeri guvernator al Egiptului în 1169. În 1171, Saladin, desemnate sultanului, abolit califatul Fatimid și în 1174, la moartea sultanului, asumat regulă independent din Egipt. Curând a devenit sultan a Siriei, precum și în victorii peste cruciaților recâștigat majoritatea Palestinei.
În al cincilea rând Cruciada, 1218-1221, forțele creștine au invadat Egiptul, dar au fost în curând conduse înapoi. În al șaptelea Cruciada, 1248-1254, de asemenea, îndreptate la Egipt, armata creștină condusă de regele Ludovic al IX-lea al Franței a fost înconjurat și capturat.
victorios armata egipteană a fost compusă în mare parte din Mamelucii, străine (în special din Turcia și cerchez) călăreți. În 1250, în timpul unei lupte pentru tron dintre urmașii lui Saladin, un mameluc se sultan făcut. Egipt se confruntă în curând un nou amenințare, ca invadatorii mongoli cucerit Persia și a început spre vest. În 1260, armatele mameluc și mongole întâlnit în Palestina, aproape de Nazareth, și forța de Mongol a fost distrus.
Articolul Otoman
Perioada timpurie a statului mameluc din Egipt a fost una de prosperitate și creștere comerțul maritim cu atât Asia și Europa. Țara în curând a fost slăbită de lupte interne pentru putere, cu toate acestea, și în secolul 15 a fost afectat de secetă și foamete. După portughezi în 1497-1498 a navigat în jurul Africii pentru Indiile de Est, rolul Egiptului în comerțul mondial a scăzut.
turcii otomani, care au reușit Seljuks și absorbite Imperiul Bizantin, în 1517 a învins Mamelucii și anexat imperiul lor. După achiziționarea Egipt, turcii au arătat puțin interes în ea. Mamelucii au fost permise pentru a servi ca bei (guvernatorii provinciilor); treptat bei lider a devenit practic un monarh.
În 1798, în timpul războiul dintre Franța și Marea Britanie a adus pe de Revoluția Franceză, Napoleon Bonaparte a invadat Egiptul, care prezintă o amenințare la adresa britanic deținute India. Britanic și otomane turcii forțat o retragere france