Cruciadele, care a început în 1096, armatele romane au adus din catolici Europa de Vest mărșăluind în țările ortodoxe de Est din Balcanii de pe drumul lor spre Țara Sfântă. Antagonism între Crusaders și populațiile indigene au crescut în mod constant. În 1204 a patra cruciade, legat inițial pentru Egipt, în loc capturat Constantinopol (Istanbul) și a preluat o mare parte a Imperiului Bizantin, care a fost redenumit Imperiul latin (de rit latin a bisericii romane). Statele Crusader au fost înființate în Grecia și în fruntea a Mării Egee, iar orasul-stat Veneția ocupat mai multe porturi la Marea Adriatică.
Odată cu căderea Bizanțului, un al doilea Imperiu Bulgar a fost înființată și Serbia a devenit un regat independent. Imperiul Bizantin a fost reînființată în 1261, dar îi lipsea fostul său putere. Serbia a intrat pe o perioadă de expansiune și de la mijlocul 1300 lui a creat un imperiu mare. Bosnia, extinderea în aceeași perioadă, anexat vecină Herțegovina. Ungaria a extins spre sud.
În 1354 turcii otomani, care au cucerit deja de cele mai multe Asia Mică, a trecut în Balcani. Imperiul Bizantin a scăzut la acestea în 1453, și până în secolul al 16-lea, practic întreaga peninsulă a fost cucerită.
Modern Perioada
După ce mare sa era de cucerire și expansiune, Imperiul Otoman a scăzut treptat în vigoare. Austria și Rusia au fost atât aplecat pe câștig teritorial, și venețienii a vrut să restabilească rutele lor comerciale. Otomanii au fost frecvent în război cu unul sau mai multe dintre aceste competențe și de 1,700 au început să-și piardă teritoriu în Balcani. Războaie continue în secolele 18 si 19 a dus la pierderi suplimentare. Grecia a fost primul care a obține independența, în 1832, și până la sfârșitul secolului al cele mai multe dintre celelalte țări din Balcanii au câștigat independența, de asemenea,.
Cele două războaie balcanice, 1912-1913, statul turc a eliminat în Europa cu excepția în regiunea din jurul Constantinopolului. Imperiul Austro-Ungar a avut loc pe teritoriul în nord-vest, dar Rusia nu a reușit să pătrundă în Balcani. Resentiment împotriva Austriei a fost cauza incidentulu