Sistemul judiciar este condus de Curtea Supremă de Justiție, membrii care sunt numiți de către Cabinetul. Curtea Supremă de Justiție poate pronunța asupra constituționalității legilor și a acțiunilor guvernamentale.
Japonia este împărțit în 47 de districte administrative numite prefecturi. Deși Constituția interzice menținerea forțelor militare, Japonia are teren puternic, mare, și unitățile de aer numit Forțelor auto-apărare.