De asemenea, în timp ce acestea sunt ieftine, odată sticla de comprimate chimice este deschis, are o durată de viață limitată. Un alt dezavantaj al tratare a apei chimic este că nu funcționează întotdeauna împotriva anumitor tipuri de protozoare. În cele din urmă, în cazul în care vremea este deosebit de rece sau apa este umplut cu sedimente, tabletele chimice va dura mai mult pentru a lucra.
Cel mai mare dezavantaj al tratamentului chimic este efectele negative asupra sănătății poate avea asupra unor oameni. Pentru persoanele cu boli tiroidiene, imunodeficientei si alte probleme de sanatate, tablete care conțin iod poate chimice fi o amenințare gravă. De asemenea, dacă sunteți gravidă, este important de a vorbi cu un medic înainte de a folosi iod pentru purificarea apei.